سیدمحمد خاتمی، رئیس‌جمهوری اسبق ایران، با صدور پیامی درگذشت علی‌اصغر فانی، وزیر اسبق آموزش و پرورش را تسلیت گفت و از خدمات او در عرصه تعلیم و تربیت تجلیل کرد. خاتمی در این پیام، فانی را «چهره درخشان علم و فضیلت و تعلیم و تربیت» توصیف کرد و نوشت: «این بزرگوار که از خدمتگزاران صدیق اسلام و انقلاب و ایران بود، نقش ممتازی در عرصه آموزش و پرورش و تعلیم و تربیت داشت و خدمات ارزنده او همواره مورد تقدیر آنان که انقلاب و ایران را پاس می‌دارند، خواهد بود» .
علی‌اصغر فانی که سابقه وزارت در دولت‌های نهم و یازدهم را در کارنامه داشت، عصر پنجشنبه ۱۴ آبان ۱۴۰۵ پس از دوره‌ای بیماری در سن ۷۲ سالگی درگذشت . او دانش‌آموخته دکترای مدیریت دولتی از دانشگاه تربیت مدرس و عضو هیئت علمی دانشکده مدیریت این دانشگاه بود و سال‌ها در سمت‌های مدیریتی آموزش و پرورش از جمله مدیرکلی آموزش متوسطه فعالیت کرده بود .
خاتمی در ادامه پیام خود، این مصیبت را به «همه اصحاب فضیلت و فرهنگ، به خصوص اصحاب گرامی آموزش و پرورش و به اخص دوستان، یاران و شاگردان او» تسلیت گفت و از درگاه خداوند برای روان او آمرزش و برای بازماندگان صبر و اجر مسئلت کرد . در کنار خاتمی، مسعود پزشکیان رئیس‌جمهور نیز با صدور پیامی جداگانه، فانی را «از خدمتگزاران باسابقه عرصه تعلیم و تربیت کشور» خواند و درگذشت او را تسلیت گفت .
